 祇園禪寺居九華山四大叢林之首。初建於十六世紀中期、明代嘉靖年間，清代多次重修和增建。祗園本來是印度佛教聖地，相傳釋迦牟尼在祗園宣揚佛教二十餘年，祗園寺就是取這個故事而得名。祗園寺通道刻滿金錢，以像徵釋迦聖跡。
祇園寺始建於明代，清康熙年間為化城寺東序寮房之一，後為四大叢林之冠。清代寺院住持隆山和尚84歲圓寂，”端坐而逝”，肉身不腐，僧德高尚，為世所崇。 1933年於佑任手書”大雄寶殿”現仍置於大殿。同年上海高旻寺首座了願法師，在此開講”地藏經”。廚房有民國時期苑口大銅鍋，最大一口直徑員73厘米、高緣遠厘米，人稱”千僧灶”，可見當時佛事之盛。九華山對外開放後，九華山佛協在此多次舉辦大型傳戒、講經法會和”祈禱和平息災法會”，現每年舉行水陸法會、焰口等佛事活動千餘台，為全山佛事活動中心之一。
祇園寺現為九華山惟一叢林寺院，由山門、天王殿、大雄寶殿、客堂、齋堂、庫房、退居寮、方丈室、講堂和藏經樓等十餘座單體建築組成，為典型組合式建築。其山門偏離大殿中軸線，斜置山門頗有講究，一是為了”辟邪”，二是門向朝著開山祖寺化城寺。大雄寶殿琉璃碧瓦，翹角飛簷，地位十分突出。配殿去規整而散置，分別建在幾處不同高度平台上。整個建築回環曲折，結構精妙，氣宇軒昂。院內古松挺立，花草叢生，亭台：閣錯落有致，實為靜修佳地。祇園寺前院牆有一條石刻”泰山石敢當”，說是為了辟邪鎮妖，這緣個大字十分醒目，唯祇園寺獨有。
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